MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Calothrix sp. PCC 6303 chromosome

Total Repeats: 28954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019751	TAT	2	6	1	6	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019751	ACT	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019751	CAT	2	6	1435	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019751	AAATT	2	10	2752	2761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019751	ATTAA	2	10	2815	2824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019751	CTC	2	6	2861	2866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_019751	CTC	2	6	2869	2874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_019751	GCTT	2	8	3940	3947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_019751	CTAACT	2	12	4005	4016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_019751	GTT	2	6	4027	4032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019751	GAGT	2	8	6250	6257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019751	AAG	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019751	TAT	2	6	6335	6340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019751	ATG	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019751	ACT	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019751	CAC	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_019751	TAAT	2	8	7619	7626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019751	GCT	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019751	A	6	6	7675	7680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019751	CTA	2	6	7689	7694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019751	CAA	2	6	7713	7718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019751	TGG	2	6	7755	7760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019751	TAAA	2	8	8341	8348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019751	CTT	2	6	9113	9118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_019751	TCT	2	6	9126	9131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019751	T	7	7	9177	9183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019751	AAAGT	2	10	9265	9274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019751	TCA	2	6	9307	9312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019751	TTTGG	2	10	9334	9343	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019751	AAC	2	6	9377	9382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019751	TA	3	6	10220	10225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019751	CTTT	2	8	10276	10283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019751	TCA	2	6	10284	10289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019751	AAT	2	6	10356	10361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019751	TTAA	2	8	11449	11456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019751	CTT	2	6	11465	11470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019751	G	6	6	11490	11495	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019751	ATC	2	6	11502	11507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019751	ACT	2	6	11544	11549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019751	T	6	6	11654	11659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019751	CTAAAT	2	12	11675	11686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019751	AT	3	6	11685	11690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019751	A	8	8	11750	11757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019751	TTCA	2	8	11804	11811	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019751	ACA	2	6	11826	11831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019751	ATT	2	6	11835	11840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019751	GA	3	6	11849	11854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019751	A	6	6	11884	11889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019751	AAG	2	6	11894	11899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019751	CTT	2	6	11908	11913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019751	TGG	2	6	13328	13333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019751	ATT	2	6	13413	13418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019751	A	6	6	13477	13482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019751	ATT	2	6	13552	13557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019751	TAC	2	6	13710	13715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019751	GCA	2	6	13850	13855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019751	TTG	2	6	13952	13957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019751	AGAC	2	8	14002	14009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_019751	T	7	7	14233	14239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019751	A	8	8	14250	14257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019751	ATT	3	9	14295	14303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019751	A	6	6	14322	14327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019751	CAA	2	6	15370	15375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019751	A	6	6	15399	15404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019751	ATC	2	6	15408	15413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019751	ACG	2	6	16410	16415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_019751	AGC	2	6	16424	16429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019751	TCG	2	6	16438	16443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019751	CCA	2	6	16485	16490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019751	ACT	2	6	16509	16514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019751	ATT	2	6	16569	16574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019751	GGA	2	6	16584	16589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019751	GCC	2	6	16592	16597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_019751	CTT	2	6	16618	16623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019751	GAA	2	6	16722	16727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019751	ATC	2	6	16729	16734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_019751	TAGA	2	8	18195	18202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019751	A	6	6	18229	18234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019751	GTAA	2	8	18240	18247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019751	ATT	2	6	18257	18262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019751	AC	3	6	18264	18269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_019751	TAAT	2	8	18312	18319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019751	ACT	2	6	18328	18333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_019751	ATC	2	6	18421	18426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_019751	TTA	2	6	18445	18450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019751	TTGA	2	8	19205	19212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019751	CAATA	2	10	21770	21779	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_019751	AAAT	2	8	21844	21851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019751	TG	3	6	21896	21901	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019751	GTA	2	6	21904	21909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019751	ACA	2	6	21934	21939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019751	A	6	6	21943	21948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019751	AGT	2	6	22036	22041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019751	GCA	2	6	22043	22048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_019751	CAA	2	6	23499	23504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019751	ATG	2	6	23548	23553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019751	CCA	2	6	23594	23599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_019751	TTG	2	6	23614	23619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019751	T	6	6	23666	23671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019751	TAA	2	6	23717	23722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019751	CA	3	6	23766	23771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_019751	A	7	7	23779	23785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019751	ATC	2	6	23807	23812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_019751	GCA	2	6	23826	23831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019751	ATTATC	2	12	24432	24443	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_019751	AT	3	6	24445	24450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019751	ATCA	2	8	24457	24464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_019751	ATTT	2	8	28643	28650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019751	CAAG	2	8	29739	29746	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019751	GTC	2	6	29755	29760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019751	AAT	2	6	29798	29803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019751	AGTA	2	8	29914	29921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019751	TG	3	6	31905	31910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019751	ATC	2	6	32162	32167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019751	TTC	2	6	32263	32268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019751	TAT	2	6	32793	32798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019751	A	6	6	32907	32912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019751	AT	3	6	32928	32933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019751	CAA	2	6	32968	32973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019751	A	6	6	33016	33021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019751	T	6	6	33566	33571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019751	GTT	2	6	33575	33580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019751	CAT	2	6	33603	33608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019751	TA	3	6	33629	33634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019751	ATT	2	6	33646	33651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019751	ATT	2	6	33685	33690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019751	AAC	2	6	33696	33701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019751	AAAT	2	8	33723	33730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019751	ATTT	2	8	33731	33738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019751	TAA	3	9	36108	36116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019751	AATT	2	8	36169	36176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019751	ATT	2	6	36222	36227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019751	ACTA	2	8	36228	36235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_019751	AAG	2	6	37065	37070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019751	G	6	6	37072	37077	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019751	AAT	2	6	39120	39125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019751	A	6	6	39130	39135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019751	AG	3	6	39150	39155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019751	CAATC	2	10	40157	40166	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_019751	TTAG	2	8	40189	40196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019751	CTT	2	6	40268	40273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_019751	ATT	2	6	40275	40280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019751	CAA	2	6	40337	40342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_019751	AATT	2	8	40421	40428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019751	ATC	2	6	40493	40498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019751	TA	3	6	40499	40504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019751	AT	3	6	40516	40521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_019751	GTA	2	6	42831	42836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019751	TA	3	6	42835	42840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019751	ATT	2	6	42853	42858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_019751	AC	3	6	42967	42972	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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441	NC_019751	T	6	6	103984	103989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_019751	TAA	2	6	112115	112120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_019751	AAT	2	6	113802	113807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_019751	A	6	6	113842	113847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_019751	CAA	2	6	115968	115973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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485	NC_019751	TA	4	8	117321	117328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_019751	CTCA	2	8	118122	118129	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_019751	ATT	2	6	121474	121479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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